In het museum is een hele serie medische instrumenten te vinden die in Epidaurus gebruikt zijn. Ook staat er een kouros en een grensverdrag tussen Korinthe en Epidaurus. Omdat de meeste originele stukken in het museum van Athene staan zijn in dit museum vooral brokstukken van de gebouwen van het heiligdom. Er zijn Ionische en Korinthische colonnades van de bankethal, leeuwenkoppen afkomstig van de tempel van Asclepius en platen van het plafond vol planten- en bloemenmotieven te zien. Ten slotte is er een beeld van Asclepius, een beeld van Hygieia (de dochter van Asclepius, godin van de hygiëne) en een vrouwenfiguur met een afbeelding van Medusa.